1.根據《中華人民共和國個人所得稅法實施條例》(國家707號令)第六條第四款規定：“特許權使用費所得，是指個人提供專利權、商標權、著作權、非專利技術的使用權和其他特許權取得的所得；提供著作權使用權的收入不包括稿酬收入。”

二。根據《國家稅務總局關于發布個人所得稅扣繳申報管理辦法（試行）的公告》(中華人民共和國國家稅務總局公告2018年第61號)第八條規定：“扣繳義務人向居民個人支付勞務報酬、稿酬、特許權使用費所得時，應當按照下列方法按次或者按月扣繳預繳稅款：

稿酬、稿酬、特許權使用費所得，為收入減除費用后的余額；其中稿酬收入減少70%。

費用扣除：預繳稅款時，勞務報酬、稿酬、特許權使用費所得每次不超過4000元的，按800元計算扣除費用；每次收入在4000元以上的，按收入的20%計算扣除費用。

應納稅所得額：勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得。各項所得的金額作為應納稅所得額的扣繳額，計算扣繳稅款。勞務所得適用個人所得稅扣繳率表二(見附件)，稿酬所得和特許權使用費所得適用20%的比例扣繳率。

個人辦理年度綜合所得匯算清繳時，應當依法計算勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得，并入年度綜合所得計算應納稅額，多退少補。"

因此，自然人轉讓商標所有權屬于特許權使用費收入，收入額應為收入扣除費用后的余額，應按照20%的扣繳率計算納稅額。年度綜合所得匯算清繳時，依法計算勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得，并入年度綜合所得計算應納稅額，多退少補。